Sedangkan untuk jadwal penerbangan dari Jakarta, Surabaya, dan Yogyakarta menuju ke Mamuju adalah sebagai berikut,

Tersedia 4 maskapai yang melayani penerbangan di jalur ini, yakni Garuda Indonesia, Kalstar, Lion Air, dan Sriwijaya Air. Dari keempat maskapai tersebut, hanya Lion Air dan Sriwijaya Air yang membuka penerbangan langsung untuk rute Jakarta – Tarakan dengan masing-masing Lion Air 4 kali dan Sriwijaya Air 1 kali dalam sehari.

Total jadwal pemberangkatan pesawat dari Jakarta menuju Tarakan ada 23 kali dalam sehari yang terdiri dari 5 jadwal penerbangan langsung ke Tarakan, dan sisanya 18 pesawat transit dahulu sebelum tiba di Tarakan. Berikut rincian dari jadwal penerbangan langsung dan Transit untuk rute Jakarta – Tarakan,

Lion Air dioperasikan masing-masing 4 kali sehari untuk rute Jakarta – Tarakan dan Tarakan – Jakarta. Di rute Jakarta – Tarakan dioperasikan armada JT 626, JT 760, JT 756, dan JT 768. Sedangkan untuk Sriwijaya Air hanya mengoperasikan 1 armadanya yakni SJ 230. Di rute berlawanan, Tarakan – Jakarta, Armada Lion Air yang diaktifkan yaitu JT 673, JT 765, JT 757, dan JT 627 ditambah dengan 1 armada SJ 231 dari Sriwijaya Air. Semua armada ini dioperasikan setiap hari (7 hari dama seminggu). Berikut rincian jadwal penerbangan untuk rute Jakarta – Tarakan PP,

Bandar Udara Internasional Juwata terletak hanya sekitar 3 km dari pusat kota Tarakan, Kalimantan Utara. Sebagai tambahan informasi, Bandara ini telah menerapkan sistem Green Aiport dan menjadi penghubung semua bandara domestik dan perintis yang ada di Kalimantan Utara. Setiap harinya, ada sekitar 3000 penumpang yang lalu lalang di Bandara ini.